手持式超声波破碎仪工作原理基于超声波在液体中的空化作用，换能器将电能量通过变幅杆在工具头顶部液体中产生高强度剪切力，形成高频的交变水压强，使空腔膨胀、爆炸将细胞击碎。另一方面由于超声波在液体中传播时产生剧烈地扰动作用，使颗粒产生很大的加速度，从而互相碰撞或与器壁互相碰撞而击碎。为了确保手持式超声波破碎仪使用的稳定性以及高效性，我们在日常操作的过程中需注意：
1、开机前务必将超声探头（超声波变幅杆）插入样品，切忌空载。
2、超声探头入水深度应在1.5cm，液面高度有30mm以上，探头应居中放置，不可贴壁。超声波是垂直纵波，插入太深不容易形成对流，影响破碎效率。
3、按要求设置破碎仪工作参数，比较敏感的样品（比如细菌）一般外面采用冰浴，实际温度肯定是低于25度，蛋白核酸肯定不会变性。
1）超声功率：不宜太大，以免样品飞溅，如小于10ml样品容量，功率应在200w以内,选用2mm超声探头，另将面板后面的变幅杆选择开关打到相应挡。
2）容器选择：应根据样品量选择容器，不宜选择过大的烧杯，如20ml的样品宜选用20ml的烧杯。这样可有利于样品在超声中对流，提高超声波破碎效率。
3）工作时间：超声持续工作时间每次不宜超过5秒，工作间隙时间应大于或等于超声时间，以便于热量散发。时间设定应以超声时间短，超声次数多原则，可延长破碎仪以及超声探头的寿命。
4）若实验中选用1.5ml的EP管盛放样品，务必将EP管固定好，以防冰浴融化后液面下降导致空载在超声波细胞破碎仪工作完毕后，也应注意将进行清洗保养，可用酒精擦洗探头或用清水进行清洗。
