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声波基因组剪切仪-百科分享

更新时间:2023-11-01 点击量:1012
  高通量声波基因组剪切仪是在传统超声波处理基础上的技术革新,通过球面固态超声换能器将声波以三维方式聚焦到样本区域,聚焦声波能够以不同角度的能量输入获得良好的处理效果,避免传统超声能量的不聚集可能引起的样本处理过度及热损伤。采用等温、旋转离心管及非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合。用于无菌、超微量破碎,隔着离心管能打断染色体。且不产生感染性飞雾,超声探头与样品不接触,避免交叉污染。自动声波聚焦通过精确的控制系统和自动化的冷水机操作,为样本处理提供高效可控、重复性优良、温度恒定及无污染的处理环境。目前已广泛应用于基因组学、蛋白质组学、细胞生物学等研究中。
 
  1.更短的波长-低至3mm波长,与生物样本大小相同数量级,更容易聚焦。
 
  2.更集中的声波-精确聚焦声波至样品区域,减少能量损失,带来更低的功耗。
 
  3.更安静更健康-临床医学级超声频率,处于安全听力范围之外,无噪音,对人体无害。

 
  基本原理
 
  通过压电转换器,将电信号转变为高频声波信号,产生数百万的分子“空穴”,利用“空穴”在几秒内变大、破裂产生的瞬时流体剪切力,通过等温、非接触的方式对样本进行打断、匀浆和混合。

 
  应用领域
 
  1.组织破碎与匀浆。
 
  2.蛋白质提取。
 
  3.蛋白质消解。
 
  4.DBS血卡收集提取。
 
  5.MALDI-TOF样本处理细胞及亚细胞组分裂解。
 
  6.ccfDNA提取。
 
  7.ChIP染色质剪切。
 
  8.DNA/RNA提取。
 
  9.生物标志物提取。
 
  10.DNA/RNA片段化。
 
  11.FFPE样本核酸提取。
 
  12.配方设计。
 
  13.脂质体制备。
 
  14.纳米颗粒制备。
 
  15.化合物分散/溶解药物合成与微粉化。

 
  不同片段化方法的对比
 
  超声波打断法
 
  1.操作简单,耗时短,成本低
 
  2.随机片段化,无GC序列偏好
 
  3.剪切效果不受DNA浓度影响
 
  4.片段化结果集中度高,目的长度片段得率高
 
  酶切法
 
  1.实验要求严格,针对不同样本合适的片段化条件摸索不易,成本较高
 
  2.存在序列偏好性
 
  3.需要根据样本浓度改变酶浓度,酶活性易受到溶液成分影响
 
  4.目标长度片段集中度较低

 
  传统探头和非接触式的对比
 
  1.传统探头超声波破碎仪
 
  1)探头与样品直接接触,有金属离子污染,一次只能处理一个样品,实验周期长。
 
  2)对于多个样品,需要重复使用同一探头,容易造成样品交叉污染。
 
  3)由于每次探头插入样品的深度不一,每次超声的能量分布也不尽相同,影响实验结果的重复性和准确性。
 
  4)由于不能采用封闭系统,在超声过程中产生的气雾或者泡沫会扩散到环境中,造成潜在的生物危险。

 
  2.非接触式超声波破碎仪
 
  1)除了传统的手持探头,固定探头的繁琐。
 
  2)消除了样品交叉污染的危险;能隔着离心管能打断染色体、破碎细胞。
 
  3)无气雾浮质产生-增强生物安全性,用于无菌操作。